Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC061212Q6P8K3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC061212Q6P8K3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms