Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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