Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp4aQ64436 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp4aQ64436 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp4aQ64436 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms