Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn4Q62472 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn4Q62472 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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