Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms