Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms