Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ttf1Q62187 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ttf1Q62187 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Ttf1Q62187 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Ttf1Q62187 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Ttf1Q62187 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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