Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga7Q61738 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga7Q61738 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga7Q61738 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms