Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msi1Q61474 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msi1Q61474 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms