Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms