Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms