Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Trappc1Q5NCF2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms