Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim58Q5NCC9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Trim58Q5NCC9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Trim58Q5NCC9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Trim58Q5NCC9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim58Q5NCC9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms