Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnni3kQ5GIG6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms