Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10488Q4KL05 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms