Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Syne3Q4FZC9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syne3Q4FZC9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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