Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa20Q45VN2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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