Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnga4Q3UW12 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms