Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Acsf3Q3URE1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Acsf3Q3URE1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms