Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rmdn3Q3UJU9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rmdn3Q3UJU9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms