Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd2Q3UGR5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms