Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fam35aQ3UEN2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Fam35aQ3UEN2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Fam35aQ3UEN2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Fam35aQ3UEN2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Fam35aQ3UEN2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam35aQ3UEN2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms