Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CcnjQ3TZI6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms