Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rtl9Q32KG4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rtl9Q32KG4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rtl9Q32KG4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rtl9Q32KG4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rtl9Q32KG4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rtl9Q32KG4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rtl9Q32KG4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtl9Q32KG4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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