Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH17

Trim72, Tripartite motif-containing protein 72, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim72Q1XH17 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim72Q1XH17 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim72Q1XH17 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim72Q1XH17 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim72Q1XH17 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim72Q1XH17 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim72Q1XH17 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms