Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne9Q1RLL3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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