Protein–RNA interactions for Protein: Q17ST2

Kcna7, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 7, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna7Q17ST2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Kcna7Q17ST2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms