Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms