Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms