Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apoc2Q05020 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms