Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top1Q04750 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top1Q04750 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms