Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htr1fQ02284 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms