Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms