Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pax8Q00288 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms