Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thumpd3P97770 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd3P97770 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms