Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
rp9P97762 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
rp9P97762 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms