Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SgcdP82347 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SgcdP82347 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SgcdP82347 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SgcdP82347 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SgcdP82347 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SgcdP82347 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SgcdP82347 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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