Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx3P81067 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms