Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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