Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps3P62908 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms