Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps11P62281 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms