Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppfia3P60469 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms