Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms