Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcstnP57716 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms