Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AgrpP56473 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AgrpP56473 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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