Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtswP56203 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtswP56203 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtswP56203 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtswP56203 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms