Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41l4aP52963 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41l4aP52963 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms