Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psen1P49769 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms