Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PpargP37238 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PpargP37238 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PpargP37238 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PpargP37238 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms