Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RxrgP28705 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RxrgP28705 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RxrgP28705 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RxrgP28705 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms